微波对生物体的热效应指的是由微波引起的生物组织或者是系统受热而对生物体产生的影响，微波干燥设备也有微波的热效应。热效应主要是指生物体内有极分子在微波高频电场的作用下反复地快速转动而摩擦生热的。体内离子在微波作用下振动也会将振动能量转化成热量，一般分子也会吸收微波能量后让热运动能量增加。如果生物体组织吸收的微波能量比较少的话，它可以借助自身的热调节系统通过血循环将吸收的微波能量(热量)散发到全身或体外。

    微波干燥设备的微波同样也有非热效应。在微波电磁场的作用力下，生物体内的一些分子将会产生变形振动，让细胞膜功能受到一些影响，使细胞膜内外液体的电状况发生变化，引起生物作用的改变，进而会影响到系统等。对微波干燥设备的非热效应，人们还了解的不是很多。当生物体受强功率微波照射时，热效应是比较重要的，长期的低功率密度微波辐射主要引起非热效应。