微波杀菌设备适用于食品领域的各种物料杀菌。比如说：调味品、添加剂、鸡粉、蛋白粉、肉制品、鱼制品、海产品等物料。微波杀菌设备常规的热力杀菌是通过热传导、对流或者辐射方式将热量从物料的表面传至内部，要达到杀菌的温度，往往需要很长的时间。而微波杀菌设备则是通过微波能与物料中等微生物直接反应，热效应和非热效应共同作用，达到快速升温的目的，处理时间大大地缩短。各种物料的杀菌时间一般是在3到5分钟，杀菌温度在70至90°。其特点是时间短，速度快，杀菌均匀，低温杀菌，可以保持物料的营养成分和风味，节能，设备操作很简单，可控性好，工艺先进等。

    微波杀菌设备可分为包装后杀菌和包装前杀菌。包装容器不能用金属质地的，需要用介质材料，一般是用塑料软包装或者玻璃，工程塑料质地容器为 。为了防止在微波杀菌过程中涨袋，设备可以在工作仓内施加压力采用反压杀菌工艺，可防止涨袋的损失。