微波杀菌设备对食品加工行业作用很大，其穿透性可以使微波到达食品内部使食品中的水分子产生24亿/秒的摩擦而产生热量。利用热效应和非热效应的共同作用同时进行微波干燥和微波杀菌。这样可以省去食品在加工过程中灭菌的程序，节约人工，节省时间。
    微波杀菌设备能对食品加热干燥，解冻杀菌和熟化脱水，在保证食品的营养和风味方面更是比传统设备抚育技高一筹。对于附加值高的行业，如海产品微波烘干脱水，干果坚果微波干燥，名贵药材加工等都对产品的要求较高。所以使用微波干燥杀菌设备，可以帮助食品加工行业提升企业竞争力。
    利用微波杀菌设备还可以使食品在微波场作用下进行熟化加工。海产品休闲食品是现时流行的包装食品，如何对其进行熟化灭菌呢？这个技术难题摆在企业面前，似乎难以跨越。可是就在广州市，有一家出品休闲食品深受办公室和学生的青睐。就是工业微波设备让广州的休闲食品走向市场。谁也没想到微波技术和食品加工能一拍即合。