微波对生物体的热效应是指由微波引起的生物组织或系统受热而对生物体产生的生理影响，微波干燥设备也具有微波的热效应。热效应主要是生物体内有极分子在微波高频电场的作用下反复快速转动而摩擦生热。体内离子在微波作用下振动也会将振动能量转化为热量，一般分子也会吸收微波能量后使热运动能量增加。
    微波的非热效应是指除热效应以外的其他效应，如电效应、磁效应及化学效应等，微波干燥设备的微波同样具有非热效应。在微波电磁场的作用下，生物体内的一些分子将会产生变形和振动，使细胞膜功能受到影响，使细胞膜内外液体的电状况发生变化，引起生物作用的改变，进而可影响系统等。对于微波干燥设备的非热效应，人们还了解的不很多。当生物体受强功率微波照射时，热效应是主要的，长期的低功率密度微波辐射主要引起非热效应。
    虽然微波干燥设备也是利用了微波的热效应和非热效应，但是微波只出现在设备箱体内部，不会对人体产生影响，所以不必担心。当然，如果是长时间近距离在微波干燥设备旁工作的人，好做好相应的措施。