1.时间短，速度快。相比传统的热杀菌，需要通过热传导、对流或辐射将热量从食物表面传递到内部，达到灭菌温度通常需要很长时间。微波杀菌设备则是微波能量与食物、细菌等微生物之间的直接相互作用，以及热效应和非热效应的共同作用，从而完成快速加热杀菌的目的，从而大大缩短了处理时间。

2.保持了营养成分和传统风味。通过特殊的加热和非加热作用进行杀菌，可以在更低的温度和更短的时间内获得所需的杀菌效果。

3.它是直接作用于材料，因此没有额外的热损失。对比传统的热杀菌，它可以节电30%-50%。

4.控制微波灭菌处理，传输速度可从零开始连续调节，操作方便。

5.能够改善工作条件，节省占地面积。